Het Landelijk Bestuur (LB) is verantwoordelijk voor het draaiende houden van PROTEST op landelijk niveau en het sturen van de verschillende organen binnen de vereniging. Zo zorgt het bestuur voor gezellige en inhoudelijke activiteiten voor leden, dat PROTEST een fijne, inclusieve en veilige plek is voor alle leden, en voert het LB het beleid en de koers uit dit het congres heeft vastgesteld. Ook is het bestuur bezig met ledenwerving, het ondersteunen van afdelingen, het vertegenwoordigen van de vereniging naar buiten, de financiën en het stimuleren van politieke ontwikkeling. Het bestuur bestaat uit maximaal 8 personen.